Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ubqln3Q8C5U9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ubqln3Q8C5U9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms