Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
4933409G03RikQ8C5U0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms