Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Atg16l1Q8C0J2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Atg16l1Q8C0J2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Atg16l1Q8C0J2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg16l1Q8C0J2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Atg16l1Q8C0J2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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