Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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