Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ctdsp2Q8BX07 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ctdsp2Q8BX07 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms