Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4aQ8BW72 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4aQ8BW72 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms