Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pggt1bQ8BUY9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms