Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms