Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Smarcal1Q8BJL0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smarcal1Q8BJL0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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