Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pcsk9Q80W65 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pcsk9Q80W65 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms