Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pnma8aQ80VM8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pnma8aQ80VM8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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