Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ckap2lQ7TS74 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ckap2lQ7TS74 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms