Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim12Q78RX3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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