Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp8b3Q6UQ17 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms