Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ecm29Q6PDI5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ecm29Q6PDI5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ecm29Q6PDI5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ecm29Q6PDI5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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