Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slf2Q6P9P0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms