Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smchd1Q6P5D8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms