Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
NipblQ6KCD5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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