Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q6DFW0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q6DFW0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms