Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pdzrn3Q69ZS0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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