Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Atg9aQ68FE2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg9aQ68FE2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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