Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Surf4Q64310 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Surf4Q64310 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms