Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Polr2kQ63871 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Polr2kQ63871 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms