Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hes3Q61657 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms