Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tfap2bQ61313 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tfap2bQ61313 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms