Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a4Q60857 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a4Q60857 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a4Q60857 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a4Q60857 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc6a4Q60857 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc6a4Q60857 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Slc6a4Q60857 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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