Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atf3Q60765 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atf3Q60765 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms