Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf123Q5XPI3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf123Q5XPI3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf123Q5XPI3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf123Q5XPI3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf123Q5XPI3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf123Q5XPI3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf123Q5XPI3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf123Q5XPI3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf123Q5XPI3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf123Q5XPI3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf123Q5XPI3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf123Q5XPI3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf123Q5XPI3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf123Q5XPI3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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