Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TefmQ5SSK3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms