Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbm27Q5SFM8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbm27Q5SFM8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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