Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trim58Q5NCC9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim58Q5NCC9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim58Q5NCC9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim58Q5NCC9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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Trim58Q5NCC9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim58Q5NCC9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms