Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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Znf608Q56A10 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf608Q56A10 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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