Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC051142Q3V0M8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC051142Q3V0M8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC051142Q3V0M8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC051142Q3V0M8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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