Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrc43Q3V0L5 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc43Q3V0L5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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