Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ttc9Q3V038 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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