Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms