Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms