Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
E130208F15RikQ3UPV3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms