Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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