Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trafd1Q3UDK1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms