Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LbrQ3U9G9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LbrQ3U9G9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms