Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms