Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q3U595 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Q3U595 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q3U595 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U595 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U595 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U595 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U595 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U595 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U595 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q3U595 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q3U595 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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