Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssbp4Q3U4B1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Ssbp4Q3U4B1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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