Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Kdm4dQ3U2K5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Kdm4dQ3U2K5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Kdm4dQ3U2K5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Kdm4dQ3U2K5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Kdm4dQ3U2K5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms