Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trappc9Q3U0M1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms