Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Srsf6Q3TWW8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Srsf6Q3TWW8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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