Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fam107bQ3TGF2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fam107bQ3TGF2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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