Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RubcnlQ3TD16 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RubcnlQ3TD16 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RubcnlQ3TD16 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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RubcnlQ3TD16 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RubcnlQ3TD16 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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