Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Jmjd8Q3TA59 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Jmjd8Q3TA59 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms